Heeft niks met de veranderingen te maken, maar met de naam van het pakket.
Het pakket dat al geinstalleerd is heet virtualbox-3.1, dus als versie 3.2 uitkomt met pakketnaam virtualbox-3.2, wordt dit niet gezien als een update, maar een heel ander pakket. Daarom dat deze ook niet in de update manager verschijnt, net zoals met de overgang van versie 3.0 naar 3.1, 2.x naar 3.0 etc.
Maar als ge de VirtualBox bron hebt toegevoegd, zou normaal virtualbox-3.2 aanvinken genoeg moeten zijn, 3.1 moet dan automatisch verwijderd worden.