De kritiek op Gnome3 is vrijwel dezelfde als die op Unity. Beide zijn het interfaces die eigenlijk meer voor touchscreens ontworpen zijn en bieden ze in vergelijking met Gnome2 belachelijk weinig configuratiemogelijkheden. Daarom wordt dat dus als een stap terug beschouwd eerder dan eentje vooruit. Bij Gnome3 is er bovendien de extra kritiek, dat het incompatibel gemaakt is met de thema's en plugins die al bestonden voor Gnome2, wat dus effectief een slag in het gezicht is van iedereen die vrijwillig allerlei dingen gemaakt had voor Gnome2 en daar veel werk en vrije tijd aan besteed had.